小针刀治疗主要有三个副作用：引发皮肤感染，对血管的损伤，可能会伤及神经组织。
小针刀外形似针灸的针，但其尖端有一狭窄的刀刃，可发挥针刺及刀切割的双重功能，目前小针刀可用于颈椎病、腰椎病、软组织损伤、滑囊炎、骨关节病、神经痛和整形美容这几个方面的手术治疗。小针刀属于有创的操作，无论作用于身体哪个部位，都需要穿透皮肤，形成伤口，手术操作完成后要及时包扎伤口，防止汗液以及污染物进入伤口，否则会引起伤口感染。否则会引起伤口感染。小针刀最前端有刃，进到皮肤下面有可能会伤及血管，在局部形成血肿的可能，可能会导致皮下组织出现粘连，若出现该种情况，可以在医生的建议下适当的活动，避免粘连的情况出现。小针刀治疗神经痛方面小针刀治疗神经痛方面的疾病时，有可能会伤及皮下的神经组织，比如颈部的手术操作，如果操作动作过大，会损及局部的神经根、椎动脉，甚至损伤颈部的神经，有可能会导致远端活动以及感觉的功能的减退，这种症状出现的几率还是比较小的，只要医生受过正规的教育，解剖知识专业只要医生受过正规的教育，解剖知识专业，看哪儿，几乎是不会出现的。
小针刀可以解决许多常见病、多发病的治疗问题。术后伤口局部不可以沾水、不适合做剧烈运动，平时饮食注意清淡，多注意休息。