区别主要在于两者的成分、功效以及适用人群上。虽然两者都有减肥的功效，但是各自的侧重点不同。
在成分方面，碧生源减肥茶的主要成分是茶多酚、金银花、荷叶素，碧生源常润茶的主要成分为绿茶、土茯苓；在功效方面，碧生源减肥茶主要是辅助身体正常排出毒素，还可以排除身体多余的脂肪，进行脂肪分解，抑制脂肪被吸收，而常润茶中茶多酚和荷叶素主要是治疗便秘的问题，除此之外还能润肠；在适用人群方面，碧生源减肥茶需谨慎使用，它不适合十八岁以下的人群、孕妇以及哺乳期妇女，碧生源常润茶适宜所有人群,男女老少均可食用。在选择这两种产品时要注意相关要求，特别是减肥药，由于其含有的成分会抑制人的食欲，控制肠道吸收，所以长期服用可能会导致内分泌失调、厌食等症状。
不管是碧生源常润茶还是减肥茶，经常喝都可能会使身体产生依赖性，所以不建议长期大量服用。减肥便秘患者应多吃蔬果，多喝温水，加强锻炼，规律作息。