新生儿疫苗是可以在异地接种的，现在国家在全国已经实行国家免疫规划统一管理，只要带上儿童接种证在全国任何地区都可以进行接种。
新生儿在异地接种疫苗的注意事项：第一，家长一定要带上新生儿出生时就已经领在手里的《预防接种证》。如果发生遗失，可向儿童出生地疾控部门申请证明以及此前接种注射的记录，以便迁入地防治站工作人员根据接种记录制定后续的接种计划。第二如果新生儿已经在当地接种了疫苗，应该要让医生在卡或者其它格式的证明上注明已经接种了什么疫苗、接种时间等内容，便于返回异地后的医生按规程操作。疫苗接种的种类很多，包括乙肝疫苗、卡介苗、脊髓灰质炎糖丸、百白破疫苗等。新生儿从出生到18个月龄之内，是接种疫苗的“密集期”，在这期间，家长平均每隔一个月就要带孩子去相关单位接种一次疫苗。
如果新生儿患有发热、腹泻、感冒、皮肤病、过敏或者患有肝炎、严重心脏病等疾病的情况下，需要咨询医生的意见是否要接种疫苗。