宝宝腹泻的治疗原则为预防脱水、纠正脱水、继续饮食、合理用药，同时又分为急性期治疗和一般治疗。
首先是急性期治疗：急性腹泻时，最严重的情况是脱水及电解质酸碱失衡。如果孩子大便含水量多且腹泻次数多，极易合并脱水及电解质酸碱失衡，此时应及时到医院就诊，轻症可在医生指导下口服补液，重症需要静脉点滴补液，否则会引起孩子继发性休克，肾衰竭，当宝宝出现以下症状时，表示已有脱水现象:(1)嘴唇及皮肤干燥，失去弹性。(2)尿量减少，甚至无尿。(3)干嚎，哭的时候流不出眼泪。(4)眼窝叫陷，肉门凹陷。
其次是药物治疗：1.肠道微生态疗法：遵医嘱进行益生菌口服，如双歧杆菌、嗜酸乳杆菌、枯草芽孢杆菌等，有助于恢复肠道正常菌群的生态平衡；2.肠黏膜保护剂：能够吸附病原体和毒素，维持肠道功能，可以在医生建议下使用必奇蒙脱石散，其成分天然，药物不进入人体的血循环，不会给肝肾造成负担，宝宝也可以使用，对于细菌病毒感染、身体受冷、消化不良引起的多种急慢性腹泻有治疗效果。
日常生活中饮食应该以清淡、易消化为主，适当减少辅食。如果存在乳糖不耐受或过敏性腹泻，则需改用无乳糖奶粉；对于气候因素，气候变凉变热也会诱发消化功能紊乱，引发腹泻，要根据天气变化为宝宝加减衣服。