高位肛瘘的瘘管跨越外括约肌深部之上，也就是我们指的肛管直肠环之上。诊断要依据一些专科的检查，比如：探针的探查，直肠镜内B超，盆地的磁共振。来判断瘘管的深度，走行，还有内口的具体位置。因为高位肛瘘很深，触诊是不容易发现的。