造成大便不成形的原因较多，多与胃肠疾病相关。
临床上常见的原因包括：肠道感染性疾病，如细菌性痢疾，感染性腹泻等；肠道非感染性疾病，例如溃疡性结肠炎、非感染性腹泻等；消化不良，当进食过多的蛋白、脂肪或富含纤维素类食物后可引起；饮食不当，当进食了生冷凉硬性食物或饮酒等刺激性因素可以使肠道蠕动加快引起；其他脏器或全身疾病、药物等原因也可引起大便形状改变。